Los flexibles reducen la pasada de agua, por éso no los recomendamos, pero no es tu problema, lo tuyo pasa por la valvula de seguridad, que en tu calefón seguramente está dividida en dos partes, una está junto al piloto y la llama debe tocarla siempre, y la otra en la parte superior sujeta a la chapa con dos tornillos pequeños, (éste es tu problema), ésa pieza está para justamente detectar temperatura en ése lugar, si se calienta el calefón se apaga, porque? si los caños son de diametro inferior al que corresponde, si existen cambios de dirección a 90°, los gases calientes van a salir mas lentos, calentando por donde pasan, para probar, retirá el sensor de su lugar, alejalo de la chapa y probá, si normaliza buscá solucionar la salida de los gases quemados. Por las dudas verificá que la termocupla esté ajustada a la valvula de gas. Suerte!! Saludos.